Nature Communations:85例晚期神经内分泌肿瘤的基因组图谱揭示了亚型的异质性和潜在的治疗靶点
领域:神经内分泌肿瘤,WGS测序
题目:The genomic landscape of 85 advanced neuroendocrine neoplasms reveals subtype-heterogeneity and potential therapeutic targets
小结:
1)研究背景及方法:转移性和局部晚期神经内分泌肿瘤(aNEN)是临床中具有异质性的恶性肿瘤,其特征是基于原发肿瘤的位置、功能、分级、增殖指数和治疗的不同结果而有不同的预后。在该研究中纳入了85例晚期(局部晚期或转移性)神经内分泌肿瘤(aNEN)患者,包含69例神经内分泌瘤(NET)和16例神经内分泌癌(NEC),原发肿瘤部位最常见为中肠(41例,48%),其次为胰腺(23例,27%),12例(14%)肿瘤原发部位无法确定。获取活检组织标本,并进行全基因组测序,以揭示aNEN基因组特征及其亚群差异性。
2)研究结果:不同原发肿瘤部位与分化程度aNEN基因组具有差异性,aNEC患者中位TMB为5.45muts/Mb,TP53、KRAS、RB1、CSMD3、APC、CSMD1、LRATD2、TRRAP和MYC等为主要驱动基因,而aNET患者中位TMB较低(1.09 muts/Mb)。另外,观察到胰腺与中肠来源的NET体细胞变异存在差异性,胰腺来源的富集的基因变异有MEN1、ATRX、DAXX、DMD和CRBBP,而中肠来源为CDKN1B。最后,49% aNEN患者至少携带1个潜在治疗靶点相关变异,可指导改善aNEN的治疗策略。
3)研究结论:这是迄今为止最大样本量的aNEN全基因组测序,关注了驱动aNEN的遗传变异,并揭示了潜在的基因组改变可以用于更好地区分肿瘤亚群和新的治疗方案。